Евразийский национальный университет имени Л.Н.Гумилева, физико-технический факультет, доцент кафедры технической физики Қайнарбай А.Ж. научную деятельность начал стажер-исследователем лаборатории оптики и спектроскопии при кафедре механики и прикладной физики АГУ имени Абая.

Научную работу начинал с дипломной работы «Люминесценция кристаллов LiNaSO4» которая нашла продолжение в аспирантуре. В 2004 г. поступил в аспирантуру по специальности 01.04.07-физика конденсированного состояния Евразийского национального университета имени Л.Н. Гумилева, г. Астана. Обучаясь в аспирантуре собрал экспериментальные исследовательские комплексы по изучению рентгено-, фото- и термостимулированной люминесценции в широкой области температур от – 200 0С до +500 0С. Обучаясь в аспирантуре участвовал в реализации научно-исследовательских госбюджетных программ, как программа 055 «Фундаментальные и прикладные научные исследования 2006-2008 г.г.» МОН РК, программа «Международное сотрудничество в области науки 2007-2009, 2010-2012 г.г. в рамках Соглашений между Правительством Республики Казахстан и Украины о сотрудничестве в области науки и технологии»,  по программе «Целевое развитие университетской науки, ориентированный на инновационный результат на 2011 г.», 055 «Научная и/или научно-техническая деятельность», подпрограмма 101 «Грантовое финансирование научных исследований» на 2012-2014 гг. и многое др. По окончании аспирантуры в 2010 г. защитил кандидатскую диссертацию под руководством профессора Нурахметова Т.Н. под названием «Люминесценция и радиационные дефекты в сульфатах щелочных металлов» в Диссертационном Совете Д14А.01.11 при КазНУ им аль-Фараби в 2010 г.  

Доцентом Кайнарбай А.Ж. опубликованы статьи в специализированных отечественных международных рейтинговых научных журналах. Он регулярно участвует на международных и республиканских конференциях, выступает с докладами. 

На сегодняшний день Кайнарбай Асет работает доцентом кафедры технической физики, на физико-техническом факультете ЕНУ им. Л.Н. Гумилева. Он проводит занятия на казахском и русском отделениях. Им разработаны лекционные курсы, УМКД по спец.курсам «Фотохромные и катодохромные материалы», «Кристаллография», «Получение наноматериалов» и др. Под его руководством студенты и магистранты участвуют и выигрывают научные конкурсы, выполняют дипломные и  магистерские диссертации, ведет руководство над студенческим научным кружком «Smart Materials». Организовал при кафедре научную лабораторию «Получение и комплексное исследование наноматериалов». Результаты первых работ нашли демонстрацию на Республиканской выставке инновационных проектов «EXPO-2017 – мост в будущее» 2014 г. Астана, и широко освещаются в СМИ. За неустанный труд награжден грамотами, дипломами университета, Министра.